Les objectifs scientifiques diffèrent selon les projets, mais des dénominateurs communs sont dans presque tous les cas :
- la quantification des spots protéiques, afin d'établir des profils d'expression en fonction des facteurs étudiés (contraintes, développement...).
- la cartographie des PQL, qui est une aide pour la validation des gènes candidats
- l'identification en routine des protéines excisées des gels, indispensable pour les interprétations physiologiques
Dans ce contexte, les objectifs du réseau sont :
- l'échange d'informations et de conseils techniques sur ces approches en pleine évolution
- la reconnaissance en tant qu'interlocuteur privilégié d'une part pour les demandes de financements et les négociations sur des programmes, et d'autre part pour les fournisseurs de matériel
- le partage de spectromètre de masse MALDI-TOF, ESI-MS/MS, outil permettant l'identification en routine des protéines excisées des gels par comparaison des poids moléculaires des peptides obtenus après digestion par une endoprotéase.
- la constitution d'une base de données de protéines végétales, comprenant les séquences, le niveau d'expression selon les facteurs étudiés, la position cartographique du gène de structure et des PQL, les données bibliographiques, etc.
Pour faciliter les relations entre les membres du réseau, un alias a été créé (proteomevert@moulon.inra.fr).
Intérêt socio-économique : Les différents projets, qui portent tous sur des espèces d'intérêt agronomique et/ou des espèces modèle, concernent des caractères représentant un enjeu économique et/ou industriel évident (résistances aux contraintes, réduction des intrants, qualité du grain, qualité du bois).